高通量表观组学服务

High-throughput epigenomics

高通量全基因组DNA甲基化测序实验流程复杂,手动操作可能会引入实验误差,影响数据的质量和重复性且实验周期较长。此外,缺乏统一的操作标准和流程可能导致不同实验室之间的结果难以比较和整合。

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产品介绍

product introduction

镁伽依托全自动建库测序实验平台提供高通量表观组学服务,以全基因组DNA甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)服务为主。该服务致力于对具有参考基因组的物种进行全基因组范围内的甲基化状态深入研究,在确保数据质量的同时,也缩短实验周期,进而提升研究效率。

全自动建库测序实验平台

服务内容

Service Content

全基因组DNA甲基化测序

技术路线

technology roadmap

  • DNA提取

  • DNA片段化

  • 末端修饰

  • 接头连接

  • Bisulfite处理

  • 文库扩增

  • 上机测序

  • 数据分析

产品特点

Product Features

单碱基分辨率

WGBS能够提供单碱基水平的甲基化信息,可确定每个胞嘧啶碱基是否被甲基化

全基因组覆盖

覆盖整个基因组,包括基因体、启动子、增强子以及其他非编码区域

高准确性

Bisulfite处理保证甲基化分析的准确性

高重复性

WGBS技术具有良好的重复性,使得不同样本或实验条件下的结果具有可比性

产品参数

SPECIFICATION

检测范围

全基因组水平

仪器平台

NovaSeq(PE150)

技术参数

Rawdata 90G

建库方法

Bisulfite处理

交付标准

原始下机数据(fastq格式),Q30≥80%

交付周期

30个工作日

数据展示

Data display

GO富集分析

相关基因做GO富集分析,可以挖掘DMR调控基因相关的生物学功能,细胞组成,生物学过程。

差异甲基化区域(DMR)绘图

差异甲基化修饰位点(DMS)指在不同样本之间,甲基化修饰水平具有显著差异的胞嘧啶位点。

甲基化的分布

反应不同样本的不同上下文环境中甲基化的水平。

送样指南

Sample delivery guide

样本类型 样本量 运输条件
细胞 2*10^6个 冻存干冰运输
动植物组织 200mg,黄豆粒 液氮速冻,干冰运输
全血 >3ml 干冰运输
DNA ≥20ng/ul,总量≥1ug 干冰运输

应用场景

Application scenarios

  • 胚胎发育

  • 癌症&慢性疾病

  • 多组学联合研究

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