高通量单细胞测序服务
Single-cell RNA-seq
传统转录组测序（Bulk RNA-seq）是提取组织、器官或一群细胞的混合RNA进行测序，其仅反映细胞群体的平均表达水平，无法揭示细胞间的异质性。
产品介绍
product introduction
镁伽依托全自动建库测序实验平台提供高通量单细胞测序服务。单细胞转录组测序（scRNA-seq）是在单个细胞水平进行高通量转录组测序的一项突破性技术，可以检测出细胞之间的差异信息，从而解决细胞群体异质性问题，超越传统bulk RNA-seq的局限。
全自动建库测序实验平台
服务内容
Service Content
10x 单细胞 3’转录组
10x 单细胞 5’转录组
10x 单细胞核转录组
10x 单细胞免疫组库（VDJ）
10x FLEX石蜡样本单细胞转录组
技术路线
technology roadmap
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单细胞悬液
制备与质控 -
生成GEMs
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反转录CDNA
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文库构建
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上机测序
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数据分析
产品特点
Product Features
通量高
一次可以同时测8个样本，每个样本最多可以检测到上万个细胞
周期短
17分钟内完成上万个细胞封装，一天之内完成细胞悬液制备、单细胞捕获、扩增以及建库
捕获效率高
细胞捕获效率高达65%以上
产品参数
SPECIFICATION
检测范围
单细胞水平
仪器平台
10X Genomics
捕获细胞数
10000左右
技术参数
Rawdata： 100G，VDJ：100G+10G+10G
交付周期
30个工作日
数据展示
Data display
标准分析
细胞注释
根据已知Marker对细胞分群结果进行检测，进而对细胞定义。
Marker基因Violin图形展示
展示注释细胞类型所用marker基因以及其表达情况。
GO及KEGG分析
相关基因功能注释，挖掘有价值的通路信息。
拟时序分析
通过拟时分析可以推断出发育过程细胞的分化轨迹和细胞亚型的演化过程。
高级分析
亚群细分
提取感兴趣的细胞类型，进行细分注释及下游分析。
肿瘤CNV分析
通过CNV分析判别恶性细胞。
细胞通讯分析
对细胞之间的相互作用进行分析和研究。
转录组因子分析
针对性的对某些细胞亚群进行SCENIC分析，细胞亚群间有统计学差异的TF展示。
送样指南
Sample delivery guide
| 样本类型 | 样本量 | 运输条件 | 运输时间 |
| 动物组织 | 200mg，黄豆粒（2-8℃预冷的组织保护液） | 2-8℃ | 48h内 |
| 冻存组织 | 200mg，黄豆粒 | 干冰运输 | 不限 |
| 穿刺样本 | 2-3条，>2cm | 2-8℃ | 48h内 |
| 全血 | PBMC | ≥3ml，EDTA抗凝管 | 2-8℃ | 24h内 |
| FFPE样本 | 蜡块被包埋组织体积需>0.5cm3 | 4℃避光 | 不限 |
应用场景
Application scenarios
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胚胎发育
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癌症&疾病研究
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细胞异质性
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多组学联合研究
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